لعب نادي قفين بالدوري التابع للاتحاد الفلسطيني والذي كان تحت مسمى الدوري التصنيفي او ما يعرف بدوري المناطق اربعة مواسم وكانت ما بين عامي 2008 – 2011 وكان هذا الدوري يتكون من عدة اندية من محافظة طولكرم ومن ثم اندية من محافظات الشمال وكانت جميع هذه الاندية لم تحصل بعد على تصنيفها في الاتحاد فانها ما زالت تحت مسمى اندية المناطق ولا يحق لها اللعب خارج محافظتها او ببطولات رسمية ينظمها الاتحاد مثل بطولة كأس فلسطين او الدوريات المنظمة من قبل لجنة اتحاد الشمال التابعة للاتحاد الفلسطيني لكرة القدم .

وفي الموسم الرياضي 2010 /2011 شارك نادي قفين بدوري المناطق وكان هدفه الرئيسي التأهل لمصافي الدرجة الثالثة وقد استعد للبطولة بجدية وبقوة وقد عزز النادي فريقه بلاعبين جدد واستطاع بكل جدارة تسيد مجموعته والتي كانت تشمل اندية محافظات طولكرم وقليقيلة وسلفيت وانتقل الى الدور الثلاني والذي شمل متصدري المجموعات وكانت هذه الاندية تمثل محافظات الشمال نابلس وطولكرم وجنين وقلقية وسلفيت وكانت حيث لعبت بكل قوة واستطاع التأهل عن هذه المجموعة بعد حصوله على المركز الثاني خلف نادي اتحاد رمانة بعد اداء رجولي من اللاعبين في جميع المبارايات حيث انهى النادي جميع مباراياته دون أي خسارة وانتقلت بعد ذلك الى مصافي الدرجةالولى والتي تم تغيير مسماها الى الدرجة الثالثة والى دوري الاضواء واصبح نادي قفين من الاندية المعترف بها واصبح من الممكن ان يشارك في كل البطولات التي ينظمها الاتحاد .

وكان تاريخ 29/5/2011 العنوان الرئيسي للملحق الرياضي في جريدة الايام (قفين يتأهل الى دوري الدرجة الثالثة ) فكانت هذه هي انطلاقة النادي في هذا الدوري .
وفي موسم 2011/2012 دخل نادي قفين للمرة الاولى لخوض غمار التجربة بدوري الدرجة الثالثة وكان هذا الدوري مكون من سبعة اندية وهي الاندية الصاعدة من دوري المناطق وهم ناديي قفين ونادي اتحاد رمانة بالاضافة الى تادي شويكة ونادي فرعون ونادي نورشمس ونادي كفر الديك ونادي اهلي بلاطة وكانت المشاركة الاولى للنادي في هذا الدوري وكان من اول الفرق المؤهلة للسقوط والهبوط وذلك نظرا لقوة الاندية المشاركة ولكن اداء اللاعبين كان اكثر بكثير وفاق كل التوقعات وحصل نادي قفين على المركز الثالث متخلفا بفارق الاهداف عن صاحب المركز الثاني ونال هدفه بالمحافظة على مكانته ووجوده بهذا الدوري .

اما موسم 2012/20133 وهذا الدوري ما زال ساريا حيث خاض النادي اربع جولات ومتبقي له جولتتين وكالعادة نظرا لقلة الامكانات وعدم وجود الملعب وانعدام التدريبات فان نادي قفين دخل هذا الدوري وهو اقل المرشحين للتأهل بل كان اكثر ترشيحا للهبوط والتراجع ولكن تظافر اللاعبين والادارة والجهد الجبار المبذول من البعض القليل مع اللاعبين جعلهم يثبتوا ويؤكدوا انهم من طينة الكبار وان مكانهم الطبيعي االمضي للامام وعدم التراجع فقد كان الاداء الرجولي في جميع المبارايات وحقق خلالها النادي فوزين وتعال وخسارة وحيدة وكانت هذه المبارايات كما يلي :
نتائج مبارايات نادي قفين في الدوري
الجولة الاولى
نادي قفين 3 1 شويكة
الجولة الثانية
نادي قفين 1 3 شباب نابلس
الجولة الثالثة
نادي قفين 2 1 كفر الديك
الجولة الرابعة
نادي قفين 2 2 فرعون
الجولة الخامسة
نادي قفين - - التضامن
الجولة السادسة
نادي قفين - - حطين